阿勒泰地区有两个机场，分别是阿勒泰机场和喀纳斯机场。阿勒泰机场距离市中心约12千米，南航每天有飞往乌鲁木齐的固定航班。喀纳斯机场位于喀纳斯景区，每年只有旅游旺季通航。以下为阿勒泰机场的南航航班信息：
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航线 |
航班号 |
起飞 |
到达 |
飞行时间 |
班期 |
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乌鲁木齐—阿勒泰 |
CZ6841 |
20:55 |
22:15 |
1:20 |
1234567 |
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乌鲁木齐—阿勒泰 |
CZ6843 |
08:20 |
9:45 |
1:25 |
1234567 |
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乌鲁木齐—阿勒泰 |
CZ6845 |
12:00 |
13:20 |
1:20 |
.2345.7 |
|
乌鲁木齐—阿勒泰 |
CZ6845 |
11:50 |
13:20 |
1:30 |
1....6. |
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阿勒泰—乌鲁木齐 |
CZ6842 |
23:10 |
00:15(+1) |
1:05 |
1234567 |
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阿勒泰—乌鲁木齐 |
CZ6844 |
10:35 |
11:40 |
1:05 |
1234567 |
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阿勒泰—乌鲁木齐 |
CZ6846 |
14:10 |
15:15 |
1:05 |
1234567 |